La criatura más tierna que habita Channel Islands es el zorro isleño y no se encuentra en ningún otro lugar del planeta. Esta criatura de color gris y rojo es descendiente del zorro gris del continente, con un porte mucho menor, y no crece mucho más del tamaño de un gato doméstico promedio. Seis de las ocho Channel Islands tienen su propia población de zorros isleños, y cada una es reconocida como una subespecie única e individual. Tienen diferencias sutiles entre sí porque cada población ha logrado sus propias adaptaciones evolutivas, como una cola más corta o un hocico más largo.
En 2004, todas estas subespecies del zorro isleño fueron incluidas en el catálogo federal de especies en peligro de extinción, pero gracias a un programa de cría en cautiverio junto con otras medidas se pudo evitar la extinción de esta especie y las poblaciones actuales son más estables. En el parque nacional, los zorros habitan las islas de San Miguel, Santa Rosa y Santa Cruz. Uno de los mejores lugares para poder observar zorros es la Isla Santa Cruz, que alberga a cerca de 1,000 ejemplares, en general, se los detecta cerca del campamento Scorpion Ranch. A diferencia del zorro gris del continente, que caza solo por la noche, el zorro isleño no tiene predadores, de modo que atraviesa la isla a la luz del día.